激光切割加工有专业的计算机辅助数控程序编程软件，编制零件加工程序的工作一般在离线计算机上完成。有些简单的加工程序也可以直接在数控系统的编辑界面完成，但需花费较长时间，且无法进行复杂零件的编程排样。一般不提倡在数控系统上进行数控程序的编制，因为这将占用大量的机床使用时间，而且效率低下。在板料放置在机床工作台上之后，重要的工作是确定机床加工工件的坐标系，这个加工工件的坐标系应当与数控编程中设置的坐标系完全一致。
注意在开始加工后，有一个试切阶段，在这个阶段操作者应当观察加工情况，及时调整加工的参数，对于批量加工尤其重要。
